王文涛党组书记、部长 王受文党组副书记、国际贸易谈判代表（正部长级）兼副部长 凌 激党组成员、副部长兼国际贸易谈判副代表 涂更新党组成员、中央纪委国家监委驻商务部纪检监察组组长 盛秋平党组成员、副部长 郭婷婷党组成员、副部长 李 飞党组成员、部长助理 陈春江党组成员、部长助理
办公厅 人事司 政研室 综合司 条法司 财务司 市场建设司 流通发展司 消费促进司 外贸司 服贸司 安全与管制局 外资司 自贸区港司 合作司 贸易救济局 国际司 世贸司 亚洲司 西亚非洲司 欧亚司 欧洲司 美大司 台港澳司 电子商务司 外事司 机关党委 离退休干部局
机关服务局 外贸发展事务局 投资促进事务局 国际经济合作事务局 国际贸易经济合作研究院 中国国际经济技术交流中心 配额许可证事务局 国际商报社 培训中心 中国对外贸易中心 中国国际电子商务中心 流通产业促进中心 中国服务外包研究中心 中国国际进口博览局
中国外商投资企业协会 中俄机电商会 海峡两岸经贸交流协会 中国国际贸易学会 中国对外经济贸易会计学会 中国国际经济合作学会 中国对外经济贸易统计学会 中国世界贸易组织研究会 中国会展经济研究会 华侨茶业发展研究基金会
中国商务出版社
境内举办涉外经济技术展览会办展项目审批 援外项目实施企业资格认定 国内企业在境外开办企业（金融企业除外）核准 限制进出口货物的许可证审批 直销企业及其分支机构设立和变更审批 货物自动进口许可 赴台湾地区举办招商、办展、参展活动审批 进出口国营贸易经营资格认定 限制进出口货物的配额审批 进口关税配额审批 供港澳活畜禽经营权审批 两用物项和技术进出口审批 重点敏感商品加工贸易业务进出口审批 台湾非企业经济组织在大陆设立常驻代表机构审批
限制进出口技术的进出口许可 对外劳务合作经营资格核准 外国非企业经济组织在华设立常驻代表机构审批 从事拍卖业务许可 报废机动车回收企业资质认定 成品油零售经营资格审批 部分易制毒化学品和石墨类相关制品进出口许可 货物自动进口许可
外经贸发展专项资金网络管理 内外贸发展专项资金网络管理应用 药品流通管理 全国商务综合行政执法业务管理 单用途商业预付卡业务信息管理 全国商品交易市场信息服务 全国农产品流通体系建设管理 全国汽车流通信息管理 再生资源信息管理 中华老字号信息管理 全国拍卖行业管理 商业特许经营企业备案 全国茧丝绸产业信息服务 全国石油市场管理 内贸流通统计监测信息服务 酒类流通监测统计与管理 对外贸易经营者备案登记应用 境内举办涉外经济技术展览会办展项目备案 国际货运代理企业信息管理 技术贸易管理信息 服务贸易信息管理应用 服务外包及软件出口信息管理应用 《最终用户和最终用途说明》申请应用 外商投资综合管理应用 全国外商投资企业年度投资经营信息联合报告 对外承包工程项目备案 网络零售第三方平台交易规则查询和举报 依申请公开政府信息
深圳特办由商务部指派的特派员领导。
深圳特办下设：
1、办公室 负责深圳特办日常行政工作、财务、对外联络和后勤服务工作。
2、调研处 收集深圳内外贸、外经、外资等经济工作的重要商务信息并及时上报商务部；围绕商务部各个时期的工作重点，在当地开展有针对性的调研工作；客观、真实地将当地商务工作中存在的问题及当地企业存在的带有普遍性的问题反映到商务部；负责深圳特办网站栏目信息的发布、更新和维护工作。
3、业务处 负责签发供港、澳地区（陆运）鲜活出口许可证和签发部分深圳市企业的进出口许可证。
